氣相色譜儀的毛細管色譜、快速分離取決于毛細管色譜柱性能的好壞。  

毛細管的柱材料毛細管色譜柱的材料對制備是十分重要的，好的柱材料應該是惰性的、熱穩定、內表面光滑、容易潤濕及操作使用方便等。早期使用的柱材料有聚乙烯管、尼龍管、不銹鋼管以及玻璃管等。隨著玻璃毛細管柱改性方法的不斷發展和石英毛細管柱的出現，毛細管柱材料幾乎都是以二氧化硅為主要成分的玻璃管和石英管。石英柱由于表面惰性好、管壁薄、柔韌性好，應用越來越廣泛，目前在GC領域中石英柱已經取代了玻璃柱。  

固定相用于制備毛細管柱的固定相有兩大類：一類為固體吸附劑，另一類為固定液。氣-固吸附型毛細管柱的吸附劑有γ-Al2O3、石墨化炭黑和分子篩。氣-液分配型毛細管柱所用固定液種類繁多，主要有兩大類：一類為硅氧烷型，另一類為非硅氧烷型。常用的固定液為甲基聚硅氧烷、PEG-20M、甲基苯基聚硅氧烷以及氰丙基甲基聚硅氧烷等。  

一個好的氣相色譜儀固定液應該有好的選擇性，好的穩定性，即化學性質穩定、熱穩定，寬的使用溫度范圍以及好的潤濕性，潤濕性對制備一個好的、液膜穩定的毛細管柱十分重要。另外固定液粘度的溫度系數也應盡可能的小，至少在實際使用溫度范圍內應盡可能小，過大的溫度系數會使形成的液膜在柱溫變化時發生液膜重排而失效。  

1．長度的選擇：  

10-15米短柱，主要用于分離少于10個組份的樣品；  

20-30米中長柱，主要分離10——50個組份內的樣品；  

50米長柱，分離大于50個組份或含有難分離物質對的復雜樣品。  

2．內徑的選擇：  

標準毛細管柱的內徑，一般為0.2——0.25mm和0.3——0.35mm二種,前者較常用,柱效高,但負荷量底,必須分流進樣,用于復雜樣品分析；后者柱效略低于前者，但負荷量進步60%；內徑0.1——0.15mm為特細毛細管柱,柱效較高,負荷量較低，流失較小，適合與質譜聯用；內徑大于0.53mm為大口徑毛細管柱，負荷量接近填充柱，柱效比小口徑低，但遠遠超過填充柱，分析時間也明顯快于填充柱，可實現毛細柱柱上進樣或不用分流的直接進樣。  

3．固定液的選擇：  

盡大部分用于填充柱的色譜固定液都可作為毛細柱的固定液，基天職為涂潰型和交聯型二大類，可以根據樣品與固定液的極性相似性原則來選定：選用非極性的固定相分析非極性化合物，極性固定相分析極性化合物，一般非極性固定相更通用一些。  

4．液膜厚度的選擇：  

0.1-0.2μm，低負荷量，高溫流失小，適用于高沸點化合物樣品；  

0.25-0.33μm屬于標準液膜,較常用；  

0.5-1μm屬厚液膜,樣品負荷量大,也常用；  

1-5μm屬特厚液膜，有較高的負荷量，在高溫下流失較大，老化時間要長，適用于低沸點樣品。